CRUEL es el nombre de la organización le borró los recuerdos a Thomas y además de encerrarlo en el Laberinto, lo abandonó a su suerte en un desierto, al borde de la muerte, separándolo de los habitantes, sus únicos amigos. Con toda la información ha reunido a través de las Pruebas, puede avanzar en la cura de la Llamarada. Sin embargo, Thomas debe pasar por la Prueba Final. Para salvar a sus amigos, deben entrar en la legendaria Last City, un laberinto controlado por WCKD que puede llegar a ser el laberinto más mortífero de todos. Cualquier persona que lo consiga pasar con vida obtendrá respuestas a las preguntas que se han estado haciendo desde que llegaron por primera vez al laberinto.